Начало 1990-х годов стало для библиотеки, как и для всей страны, временем серьезных перемен. Политические события, распад привычной системы и становление независимой Республики Беларусь напрямую повлияли на работу учреждения, прежде всего в сфере комплектования. Несмотря на трудности – резкое сокращение текущих поступлений и прекращение подписки на ряд российских научных журналов, – библиотеке удалось сохранить ключевые источники пополнения фондов. При поддержке Министерства здравоохранения Республики Беларусь были налажены новые каналы комплектования, проведены переговоры с издательством «Медицина» в Москве, возобновлен документообмен с РНМБ Украины, оформлена подписка на зарубежные медицинские журналы.
1991 год ознаменовался важным шагом в сторону развития информационных технологий – в библиотеке был создан сектор автоматизации. В его распоряжении появились первые персональные компьютеры – три IBM RS/AT 286 и два отечественных ЕС 1841. Параллельно был разработан перечень платных услуг, подготовлены рекламные материалы и начата договорная работа с организациями и учреждениями. В этот же период библиотека была включена в перечень организаций, получающих бесплатные контрольные экземпляры несекретных печатных изданий, что стало дополнительным источником пополнения фондов.
В 1992 году сотрудники отдела научной обработки приступили к работе на автоматизированных рабочих местах: за год в электронную систему было введено более полутора тысяч книг и около 300 авторефератов. Кроме того, была приобретена база данных нормативно-методических документов за 1987-1992 годы на магнитных носителях, насчитывающую свыше трех тысяч документов.
В 1993 году впервые в практике РНМБ был подготовлен к изданию «Русско-белорусский медицинский словарь», включивший около 5000 терминов. Одновременно библиотека активно развивала международные связи. Благодаря поддержке читателей и общественных инициатив РНМБ получила в дар компьютер с CD-ROM-дисководом и реферативную базу данных MEDLINE, по которой ежегодно выполнялось около двух тысяч тематических запросов.
С 1994 года библиотека начала обслуживать пользователей с использованием электронного каталога. На этом этапе он насчитывал более 23 тысяч библиографических записей и продолжал активно пополняться. Сектор автоматизации укреплялся и технически: было приобретено еще три компьютера, внедрена электронная почта, оборудован отдельный рабочий кабинет с автоматизированным рабочим местом для читателей. В это же время в здании РНМБ разместилось бюро Всемирной организации здравоохранения.
1995 год закрепил достигнутые результаты. Был утвержден Устав Республиканской научной медицинской библиотеки Министерства здравоохранения Республики Беларусь. При участии РНМБ вышел в свет первый номер журнала «Медицинские новости», и в течение года было опубликовано восемь выпусков.
Несмотря на внешние трудности, именно эти годы показали, насколько важны взаимная поддержка и сотрудничество даже в самых нестабильных условиях.
